Le linéaire de berges est découpé en plusieurs zones. Selon les endroits, Les zones sont gérées soit par le Port autonome de Paris soit par Voies navigables de France.
Il existe plusieurs zones :
> les zones autorisées au stationnement du bateaux logement,
> les zones autorisées au stationnement dans le cadre de l'activité portuaire,
> les zones interdites,
> les zones de stationnement dangereux pour la circulation fluviale, qui sont interdites par arrêté préfectoral.

Pour stationner avec votre bateau logement, il faut non seulement que celui-ci soit positionné sur une zone autorisée mais aussi qu'il possède une Convention d'occupation temporaire (ou COT) qui est délivrée par Voies navigables de France ou le Port autonome de Paris. Les bateaux qui ne possèdent pas cette COT peuvent se voir infliger un doublement des redevances puis un Procès verbal de Grande voirie qui peut conduire à l'assignation devant le Tribunal Administratif et à l'obligation de paiement d'une astreinte journalière.